10 апреля 2017 года Арбитражный суд Республики Дагестан, в связи с неподведомственностью спора не стал рассматривать жалобу ПАО «РусГидро» на постановление Западно-Каспийского территориального управления Федерального агентства по рыболовству.
16 декабря 2016 года ПАО «РусГидро» было привлечено к административной ответственности по ст. 8.42 КоАП РФ и оштрафовано на 400 000 рублей за эксплуатацию Гоцатлинской ГЭС без согласования с федеральным органом исполнительной власти в области рыболовства (ч. 2 ст. 50 Федерального закона от 20.12.2004 г. №166 «О рыболовстве и сохранении водных биологических ресурсов»). В соответствии с законодательством, ведение деятельности, которая может оказать влияние на состояние водных биоресурсов и среду их обитания, должно осуществляться только при наличии согласования применяемых мер по сохранению водных биоресурсов и среды их обитания с федеральным органом исполнительной власти в области рыболовства.
Правонарушение было выявлено Центральным межрайонным отделом рыбоохраны Западно-Каспийского ТУ Росрыболовства в результате административного расследования, проведенного с привлечением специалистов дагестанского филиала ФГБНУ «КаспНИРХ».
По данным ФГБНУ «КаспНИРХ», ежегодно потери рыбных запасов от эксплуатации Гоцатлинской ГЭС на р. Аварское Койсу могут составлять 112 579,24 кг водных биологических ресурсов в год, что эквивалентно компенсационным мероприятиям по восстановлению рыбохозяйственного потенциала реки Аварское Койсу в размере 1 460 590 рублей в ценах 2016 года.
Раннее Арбитражный суд Республики Дагестан на том же основании прекратил дела по жалобам ПАО «РусГидро» на постановления по ст. 8.33 КоАП РФ (штраф 15 000 рублей), а также по ст. 8.38 КоАП РФ (штраф 200 000 рублей).